Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYT1P21579 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms