Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL9A1P20849 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms