Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms