Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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