Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CXCL3P19876 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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