Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms