Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VCLP18206 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCLP18206 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCLP18206 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCLP18206 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCLP18206 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCLP18206 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VCLP18206 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms