Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSF2RAP15509 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms