Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms