Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms