Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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