Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms