Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXC11O43248 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXC11O43248 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXC11O43248 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXC11O43248 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HOXC11O43248 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC11O43248 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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