Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GABRPO00591 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GABRPO00591 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GABRPO00591 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms