Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms