Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC169A6NNP5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms