Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms