Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC162PA2VCL2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms