Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIPSLA2A3N6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms