Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SNX13Q9Y5W8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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