Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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