Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms