Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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