Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms