Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms