Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms