Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPASTQ9UBP0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms