Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms