Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGSF9Q9P2J2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGSF9Q9P2J2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms