Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HCN3Q9P1Z3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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HCN3Q9P1Z3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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