Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms