Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PFDN4Q9NQP4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PFDN4Q9NQP4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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