Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms