Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM31Q9BZY9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms