Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms