Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms