Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms