Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms