Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTA3Q9BTC8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTA3Q9BTC8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms