Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms