Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBE2E3Q969T4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms