Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms