Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms