Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms