Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms