Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms