Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms