Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APLFQ8IW19 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms