Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms