Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX20Q7Z614 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNX20Q7Z614 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNX20Q7Z614 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNX20Q7Z614 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNX20Q7Z614 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNX20Q7Z614 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SNX20Q7Z614 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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